Hơn một thập kỷ sau khi người Na'vi đẩy lùi cuộc xâm lược của loài người vào Pandora bởi Cơ quan Quản lý Phát triển Tài nguyên (RDA),[a] Jake Sully sống với tư cách là tộc trưởng của gia tộc Omaticaya và lập gia đình với Neytiri, bao gồm các con trai Neteyam và Lo'ak, con gái Tuk, con gái nuôi Kiri (được sinh ra từ thế thân trơ của Grace Augustine), và một cậu bé loài người tên là Spider, con trai của Đại tá Miles Quaritch, người sinh ra trên Pandora và không thể được chuyển đến Trái đất trong trạng thái đông lạnh do còn nhỏ. Trước sự thất vọng của người Na'vi, RDA quay trở lại để chuẩn bị cho thế giới quê hương Pandora của họ cho sự xâm chiếm của con người, với lý do Trái đất đang chết. Trong số những RDA mới đến có 'người tái tổ hợp', thế thân Na'vi được cấy ghép tâm trí và ký ức của những người lính đã chết, với người tái tổ hợp của Quaritch đóng vai trò là thủ lĩnh của họ. Jake tiến hành một chiến dịch du kích chống lại các đường tiếp tế của RDA, nhưng Quaritch và cấp dưới của anh ta tiến hành một nhiệm vụ chống lại quân nổi dậy của Jake và bắt cóc con của anh. Jake và Neytiri đến và giải thoát hầu hết bọn họ, nhưng Spider bị Quaritch bắt đi, người nhận ông ta là con trai mình. Hắn quyết định dành thời gian với cậu để thu hút Spider về phía mình, và ngược lại, Spider dạy Quaritch về văn hóa và ngôn ngữ Na'vi. Nhận thức được mối nguy hiểm khi Spider biết về nơi ở của anh ta có thể gây ra sự an toàn cho họ, Jake và gia đình anh ta rời khỏi Omaticaya và rút lui đến bộ tộc người dân rạn san hô Metkayina ở bờ biển phía đông của Pandora. Mặc dù Jake và gia đình của anh ấy được cho trú ẩn, nhưng họ bị một số người trong bộ tộc nhìn với ác cảm do di sản loài người của họ. Tuy nhiên, gia đình học cách sống của những người sống ở rạn san hô, Kiri phát triển mối liên kết tinh thần với biển và các sinh vật của nó, còn Lo'ak kết bạn với Tsireya, con gái tộc trưởng Tonowari và vợ ông Ronal. Lo'ak đánh nhau với Aonung, anh trai của Tsireya. Khi cậu quay lại để xin lỗi trước sự khăng khăng của Jake, Aonung và những người bạn của cậu ta đã dụ cậu tham gia một chuyến đi vào lãnh thổ của một kẻ săn mồi nguy hiểm trên biển và bỏ mặc cậu mắc kẹt. Lo'ak được cứu và kết bạn với Payakan, một tulkun, một loài cá voi thông minh và theo chủ nghĩa hòa bình mà người Metkayina coi là gia đình tinh thần của họ. Khi trở về, Lo'ak nhận lỗi về mình, làm bạn của Aonung, nhưng được biết rằng Payakan là kẻ bị ruồng bỏ trong giống loài của cậu. Trong một chuyến đi đến Cây linh hồn của Metkayina, Kiri liên kết với nó để gặp mẹ cô nhưng bị lên cơn co giật dữ dội. Cô bé được chữa lành bởi Ronal, nhưng khi Jake gọi cho Norm Spellman và Max Patel để được giúp đỡ, Quaritch đã có thể theo dõi họ đến quần đảo nơi người dân rạn san hô sinh sống. Mang theo Spider bên mình, hắn ta chỉ huy một tàu săn cá voi đang săn lùng các tulkun để thu hoạch các enzym não của chúng để làm thuốc chống lão hóa có tên là amrita. Quaritch bắt đầu chất vấn gay gắt các bộ lạc bản địa về vị trí của Jake; Khi điều này không có kết quả, hắn ra lệnh cho đội săn cá voi cố tình giết các tulkun để lôi kéo Jake ra ngoài. Lo'ak liên kết về mặt tinh thần với Payakan và biết rằng tulkun đã bị trục xuất vì chú đi ngược lại đường lối hòa bình của loài mình và chiến đấu chống lại những kẻ săn cá voi RDA đã giết mẹ chú. Khi Metkayina biết về vụ giết tulkun, Lo'ak lên đường để cảnh báo Payakan, theo sau là các anh chị em của cậu, Tsireya, Aonung và Rotxo. Họ thấy Payakan đang bị truy đuổi bởi những người săn cá voi, còn Lo'ak, Tsireya và Tuk bị Quaritch bắt giữ. Khi những đứa con của họ gặp nguy hiểm, Jake, Neytiri và Metkayina bắt đầu đối đầu với loài người. Quaritch buộc Jake phải đầu hàng, nhưng khi thấy Lo'ak đang lâm nguy, Payakan đã tấn công những kẻ săn cá voi, gây ra một cuộc chiến giết chết hầu hết thủy thủ đoàn và đánh chìm con tàu. Neteyam giải cứu Lo'ak, Tsireya và Spider, nhưng bị bắn trọng thương. Jake đối mặt với Quaritch, kẻ dùng Kiri làm con tin. Khi Neytiri làm điều tương tự với Spider, Quaritch lúc đầu phủ nhận mối quan hệ của anh ta với anh ta nhưng từ chối khi Neytiri cắt ngang ngực Spider. Jake, Quaritch, Neytiri và Tuk cuối cùng bị mắc kẹt bên trong con tàu đang chìm. Jake bóp cổ Quaritch đến bất tỉnh và được Lo'ak và Payakan cứu, trong khi Kiri triệu hồi các sinh vật biển để giúp cô cứu Neytiri và Tuk. Spider giải cứu Quaritch, nhưng từ bỏ sự tàn ác của mình và gia nhập gia đình Jake. Sau đám tang của Neteyam, Jake thông báo cho Tonowari và Ronal về quyết định rời khỏi Metkayina. Tuy nhiên, Tonowari trân trọng xác định anh là một phần của gia tộc và chào đón gia đình anh ở lại. Jake và gia đình chấp nhận và tạo dựng một cuộc sống mới trên biển, Jake thề sẽ tiếp tục chiến đấu với những kẻ xâm lược loài người.
Bình luận phim Avatar: Dòng Chảy Của Nước